大餐常吃也会腻啊翻译后修饰,今天给大家推送一碟小菜
水蚤乙酰化修饰蛋白表达谱分析
Global proteomic analysis of protein acetylationaffecting metabolic regulation in Daphnia pulex
Biochimie IF=3.1
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制翻译后修饰,还会被各种时空特意分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。基于质谱的修饰组学技术可以一次性的实现对复杂样品中全部蛋白质进行大规模的修饰定性定量分析,成为蛋白功能研究领域新的热点。
水蚤(Daphnia pulex)是一种微小的浮游动物,是生态毒理学研究的一个模式物种,用于环境毒性研究。水蚤基因组和蛋白组的测序完成为水蚤应对环境毒素的研究提供翻译后修饰了坚实的基础。环境毒素往往会引发水蚤代谢通路的变化,这些通路变化中涉及到赖氨酸乙酰化修饰。本文利用LC-MS/MS对水蚤的乙酰化修饰蛋白谱进行了全面定性分析。
图:文章技术路线
本文作者最终检测到65个蛋白上有98个乙酰化修饰位点,通过生信分析(GO分析,KEGG分析)对检测到的乙酰化修饰蛋白进行功能注释与通路注释,发现这些蛋白大多都与代谢过程有关。
图:乙酰化修饰蛋白功能分析
翻译后修饰(PTM)是蛋白功能调节中非常重要的一环,很多蛋白的活性都会因为不同的修饰状态而发生改变;近年来关于翻译后修饰(PTM)的研究越来越热。基于质谱技术的修饰蛋白质组学技术不仅可以对单个蛋白的修饰位点(准确定位发生修饰的氨基酸)进行定性分析,而且可以对修饰程度进行定量分析。目前来说,对于研究较少的物种材料,主要是非模式物种,某一特殊修饰表达谱分析就可以获得非常不错的研究成果。
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【劲爆】翻译后修饰蛋白质组,全优来袭!
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